首个“现代蛙类”基因组破译

来源：深圳特区报　   发布者：张荐辕   日期：2015-03-05  

昨天，来自华大基因的消息称，中科院昆明动物所和深圳华大基因国家基因库的研究人员成功破译了高山倭蛙基因组，这是迄今为止破译的首个现代蛙类基因组，也是目前破译的第二个两栖动物的基因组。该项成果为两栖动物进化研究提供了新线索，并在美国科学院院刊（pnas）杂志在线发表。 两栖动物是脊椎动物的一个重要分支，目前已知的包括7000多个物种，代表着脊椎动物从水生到陆生这一伟大转变的过渡类群。 通过对全基因组数据分析，研究人员推算出高山倭蛙和非洲爪蟾的分歧时间大约在2.66亿年之前，比timetree项目记录的时间要早了4千万年。尽管两物种分歧时间很久，但是它们染色体间的重排特别少，说明蛙类基因组可能具有相对较慢的进化速率。进一步研究发现，在染色体内部重排速率、基因区和全基因组范围的替换速率，蛙类都比鸟类和哺乳类动物要低。揭示了两栖动物，甚至整个冷血动物，具有比恒温动物更低的进化速率。通过分析染色体断裂，融合事件，发现人的染色体间重排最剧烈，鸡和两栖动物染色体间重排相对较少。

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